Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc175E9PVB3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms