Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cngb1E1AZ71 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms