Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms