Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms