Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms