Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms