Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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