Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms