Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms