Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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