Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap70D3YVL2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap70D3YVL2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms