Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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