Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprz1B9EKR1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms