Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nxpe3B9EKK6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms