Protein–RNA interactions for Protein: B9EJI9

Tmem229a, Transmembrane protein 229A, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem229aB9EJI9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem229aB9EJI9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem229aB9EJI9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms