Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clip3B9EHT4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms