Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol6B7ZC55 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms