Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms