Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms