Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc8B2RUS7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc8B2RUS7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms