Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms