Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms