Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms