Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
JrklB2RRL2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrklB2RRL2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms