Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ythdc2B2RR83 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms