Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms