Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed5B2RPU8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms