Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms