Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms