Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf25B1AWN9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms