Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms