Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skint4A7TZF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms