Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms