Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm6880A3KG45 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6880A3KG45 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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