Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Atp8b5A3FIN4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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