Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatsperbA2RTF1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms