Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trmt1lA2RSY6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms