Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf2A2AT37 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms