Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms