Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Rtf1A2AQ19 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Rtf1A2AQ19 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rtf1A2AQ19 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms