Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3fA2ANE1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms