Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmpd1A2AKB4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Frmpd1A2AKB4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms