Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Lcn6A2AJB9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Lcn6A2AJB9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Lcn6A2AJB9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Lcn6A2AJB9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Lcn6A2AJB9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Lcn6A2AJB9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lcn6A2AJB9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms