Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramel3A2AHA7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramel3A2AHA7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms