Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930447F04RikA2AFR2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms