Protein–RNA interactions for Protein: A2A9T0

Tbkbp1, TANK-binding kinase 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbkbp1A2A9T0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbkbp1A2A9T0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms