Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms