Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm27029A2A4P4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms