Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akap17bA2A3V1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Akap17bA2A3V1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Akap17bA2A3V1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Akap17bA2A3V1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akap17bA2A3V1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akap17bA2A3V1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms