Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LI67

Frmpd2, FERM and PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd2A0A140LI67 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd2A0A140LI67 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmpd2A0A140LI67 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms